La situation change après Sedan et la chute de la Commune (à laquelle de nombreux Polonais avaient adhéré). La France souhaitant une alliance avec la Russie, le pouvoir et les hommes politiques se désintéressent des affaires et des émigrés polonais, alors que commence à disparaître la première génération de la Grande Emigration.

Au même moment, dans la partie de la Pologne occupée par l’Autriche, le régime politique se libéralise. En 1872, à Cracovie où il existait déjà une université polonaise, est fondée l’Académie des Sciences et des Lettres. Cracovie devient le principal centre de la vie culturelle polonaise. Le 18 septembre 1891, le président de la Société Historique et Littéraire, Władysław Czartoryski, signe un accord avec l’Académie des Sciences et des Lettres :

Conformément à la résolution prise le 21 octobre 1890 et avec l’autorisation du Président de la République Française (décret du 2 juillet 1891), lisons-nous dans ce texte, la Société Historique et Littéraire cède à l’Académie la propriété de ses biens meubles et immeubles, à savoir la Bibliothèque Polonaise à Paris et les autres collections appartenant à la Société, le bâtiment du 6, quai d’Orléans où lesdites collections sont conservées, ainsi que son capital […].

L’accord entre en vigueur en janvier 1893. Ainsi, dit le compte-rendu de la séance du 22 octobre 1892, la Société Historique et Littéraire est à l’origine de la création du Centre Scientifique Polonais à Paris, elle-même interrompant son activité pour de longues années.

En mars 1893, dans un appel adressé aux milieux scientifiques français, le président de l’Académie des Sciences et Lettres disait que la tâche principale du Centre serait “d’être au service des savants polonais poursuivant leurs études à Paris, mais aussi de faciliter aux savants français des échanges avec l’Académie et le monde scientifique slave.

Le premier directeur du Comité local du Centre situé dans le bâtiment de la Bibliothèque Polonaise fut Władysław Czartoryski. Władysław Mickiewicz (fils d’Adam) fut d’abord son secrétaire, puis, plus tard, le délégué de l’Académie. Ajoutons qu’au moment de la création du Centre Scientifique, l’Académie cracovienne comptait au nombre de ses membres étrangers: Louis Pasteur, Emmanuel de Noailles, diplomate spécialiste des affaires polonaises et Albert Sorel, auteur de l’ouvrage monumental L’Europe et la Révolution française, historien qui contribua dans une large mickiewiczw1dmesure au développement de la collaboration du Centre avec les milieux scientifiques français.

L’agrandissement de la Bibliothèque et l’ampleur qu’avaient prise l’activité scientifique et les conférences aboutirent à la création d’un Centre d’Études Polonaises dont la tâche principale devait consister à dispenser l’enseignement à des étudiants français. L’inauguration solennelle des cours eut lieu en 1935 avec, pour commencer, deux matières: culture et civilisation polonaises enseignées par Pierre Cazin, grand érudit et éminent traducteur de la littérature polonaise en français, et connaissance de la Pologne contemporaine dont le cours était assuré par le professeur Henri de Montfort. L’année suivante, une troisième matière est ajoutée, histoire militaire polonaise, enseignée par le général Louis Faury, ancien directeur de l’École Supérieure de Guerre à Varsovie.

Ainsi, la Bibliothèque Polonaise à Paris regroupe à cette époque: le Centre Scientifique de l’Académie, la Bibliothèque, le Musée Adam Mickiewicz et le Centre d’Études Polonaises, le tout sous la direction de Franciszek Pułaski. Une activité éditoriale et de conférences a pour but de diffuser la connaissance de l’histoire et de la politique de l’État polonais. On établit le catalogue du fonds de la Bibliothèque ouverte aux chercheurs, ainsi qu’un inventaire des principales sources ayant trait à la présence polonaise en France. La Bibliothèque devient alors le plus important centre de documentation polonaise à l’étranger et elle collabore avec les universités de toute la France.

En mars 1946 arriva à Paris Stanisław Wędkiewicz, professeur de philologie romane. Sa mission était très délicate: d’un côté, représentant l’Académie Polonaise des Sciences et des Lettres, il devait mener des entretiens préliminaires concernant l’avenir des institutions scientifiques polonaises en France, de l’autre, il jouait le rôle de médiateur dans les négociations du nouveau pouvoir polonais avec Franciszek Pułaski. Le différend entre l’émigration et le régime communiste s’avéra insurmontable. Par conséquent, l’Académie prit, lors d’une séance plénière, la résolution de séparer le Centre Scientifiques à Paris de la Bibliothèque Polonaise. L’activité du Centre et ses statuts ont été définis par une Convention et des Accords passés entre les Gouvernements Français et Polonais. En 1947, une Convention pour une collaboration intellectuelle entre la République de Pologne et la République Française a été signée à Paris. Dans son article 7, lettre “a” cette Convention, munie de pouvoir du traité, déclare le fonctionnement de la Bibliothèque Polonaise ainsi que du Centre Scientifique à Paris.

Comme le prévoyait la résolution prise un an auparavant, lors de la séance plénière de l’Académie, le Centre allait dorénavant représenter toutes les sections de l’Académie (jusqu’alors, il en représentait seulement deux, celles de philologie et d’histoire-philosophie; précisons toutefois que le département des sciences exactes et appliquées du Centre ne fut instauré qu’en 1958).

En 1949, le Centre Scientifique de l’Académie Polonaise des Sciences et des Lettres dirigé par Stanisław Wędkiewicz s’installe dans une partie du bâtiment situé au 74, rue Lauriston, puis, en 1951 après la liquidation de l’Académie, la totalité du bâtiment est attribuée à l’Académie Polonaise des Sciences crée par le régime communiste.

La première moitié des années 50 fut pour la société et pour la science polonaise une époque de terreur idéologique qui les isolait de la culture de l’Occident. Ce n’est qu’en 1956 qu’une amélioration se produisit dans ce domaine. En 1957, des accords d’échanges culturels sont signés entre l’Académie Polonaise des Sciences et le Centre National de la Recherche Scientifique; en 1958, des accords similaires sont conclus entre la Première Section de l’Académie et la Sixième Section de l’École Pratique des Hautes Études (aujourd’hui École des Hautes Études en Sciences Sociales); en 1959, la Pologne signe une convention de coopération culturelle et scientifique avec la France.

Dans les années 1950, le Centre, séparé de la Bibliothèque polonaise, a organisé l’assistance scientifique pour le pays – préparation de rapports d’experts, recherches dans les bibliothèques, collecte de documentation et tentative de faciliter le travail des scientifiques français (consultations, importation d’ouvrages, activités d’information) et des professeurs de langue polonaise travaillant en France.

Les années 1970 ont vu un renouveau de la coopération avec les scientifiques français. En tant qu’établissement de l’Académie polonaise des sciences, le Centre a participé à la célébration de nombreux anniversaires français et polonais (par exemple, le vingt-cinquième anniversaire de la mort d’Anatole France, le centenaire de la mort de Balzac, le trois centième anniversaire de la mort de Descartes, le centenaire de la mort d’Adam Mickiewicz et d’autres). En 1972, le Centre a participé à la célébration du cinq centième anniversaire de la naissance de Nicolas Copernic (organisée sous les auspices de l’UNESCO). Cependant, les conférences données au Centre par des spécialistes polonais à la communauté scientifique française sont restées la forme la plus importante de ses activités.

En décembre 1978, une séance de gala a été organisée pour célébrer le quatre-vingt-cinquième anniversaire du Centre, en présence de représentants des gouvernements polonais et français, des autorités de l’Académie polonaise des sciences et du monde scientifique français. Hélène Langevin et Pierre Joliot, petits-fils de Marie et Pierre Curie (l’une des salles de conférence porte leur nom) étaient également présents.
La loi martiale (1981-1983) et les années qui suivirent furent une période de régression et de passivité.

Les années 1990 ont été marquées par l’ouverture à la culture occidentale, la démocratisation et la dépolitisation des institutions scientifiques en Pologne. En conséquence, les possibilités de mener à bien les missions statutaires du Centre se sont considérablement améliorées. Le Centre a développé une coopération avec des universités prestigieuses en France et dans d’autres pays européens, ainsi qu’avec de nombreuses organisations polonaises.

Dans la seconde moitié des années 1990, une collaboration étroite a été établie avec l’Institut littéraire de Jerzy Giedroyc. C’est au Centre que se sont déroulées les cérémonies de remise ou d’attribution de doctorats honoris causa à l’éditeur à l’université de Wrocław (1998), à l’université de Białystok (1998), à l’université de Varsovie (1998), à l’université Maria Curie-Skłodowska (2000) et à l’université de Szczecin (2000).
Le Centre a également participé aux célébrations du bicentenaire de la naissance d’Adam Mickiewicz et du centenaire de la découverte du polonium et du radium. Le Centre s’est associé aux célébrations de l’Année Maria Skłodowska-Curie, créée à l’occasion du centenaire de l’attribution du prix Nobel de chimie à la scientifique.

L’élargissement de l’Union européenne a fait l’objet de nombreuses lectures, rencontres et discussions.

Depuis 2000, le Centre entretient une coopération continue avec l’UNESCO, l’Académie des Sciences de l’Institut de France et le Centre National de la Recherche Scientifique.

En octobre 2007, le Centre a co-organisé la célébration du cinquantième anniversaire du premier accord de coopération entre le PAN et le CNRS.
En juin 2008, le Centre a accueilli le Forum scientifique franco-polonais, au cours duquel ont été présentés diverses formes de coopération entre scientifiques polonais et français ainsi que les résultats de projets communs.

Outre les formes traditionnelles d’activité et de coopération scientifique, le Centre accueille également des concerts de musique, des rencontres avec des écrivains et d’autres personnalités culturelles, ainsi que des réunions de Français d’origine polonaise actifs dans des corporations professionnelles (Association des Médecins d’Origine Polonaise en France, Association des Ingénieurs et Techniciens Polonais en France, etc.)

Il convient de mentionner que le Centre de Paris est l’un des six centres de l’Académie polonaise des sciences à l’étranger – des stations scientifiques sont également situées à Rome (1927-), Vienne (1985-) et Kiev (2013-). Le Centre de recherche historique est situé à Berlin (1997-) et le Bureau pour la promotion des sciences PolSCA est situé à Bruxelles (2005-).
Parmi les institutions polonaises en France, des activités scientifiques sont également menées par : La Bibliothèque polonaise, le Centre pour la culture et la civilisation polonaise à la Sorbonne (Paris IV – Sorbonne) et des centres universitaires proposant des cours de philologie slave et de langue polonaise. Le Centre coopère en permanence avec ces institutions, ainsi qu’avec l’Institut polonais et l’Institut littéraire.